کتابخانه مدرسه علمیّه فاطمة الزّهراء سلام الله علیها توس از همان ابتدای تأسیس مدرسه تشکیل گردیده و به طور رسمی کار خود را از سال 1351 با 600 جلد کتاب آغاز نموده است. تا سال 1384 مجموعه کتب به حدود 6000 جلد رسید و این روند افزایشی، ادامه داشته تا اینکه در حال حاضر (آخر سال 1396) کتابخانه با 13694 جلد کتاب در 6004 عنوان و 528 نفر عضو به فعّالیّت خود ادامه می دهد.

مکان کتابخانه ابتدا در ساختمان قدیم مدرسه در اتاقی به مساحت 12 متر مربع بوده است. بعد از احداث ساختمان جدید کتابخانه نیز به این مکان انتقال یافت به گون های که هم اکنون سالنی به مساحت 32/121 مترمربع با ظرفیّت سالن مطالعه برای 50 نفر مشغول به ارائه خدمات می باشد.

سیستم کتابخانه تا سال 1388 به صورت دستی اداره می شد اما اینک به صورت رایانه ای و براساس رده بندی کنگره عمل می نماید.

اهداف واحد کتابخانه

1. سرعت بخشیدن به انجام فعّالیّت های پژوهشی از طریق ایجاد تسهیلات مطالعاتی.
2. ایجاد انس و علاقه نسبت به مطالعه و کتاب.
3. گردآوری، حفاظت، سازماندهی و اشاعه اطلاعات مربوط به آثار مکتوب به صورت اختصاصی در زمینه دین و علوم اسلامی.
4. شرکت در نمایشگاه ها و بازدید از نمایشگاه های مرتبط با کتاب و کتابخانه.

فعّالیّت های واحد کتابخانه

      1. جمع آوری منابع

در این زمینه بعد از نیاز سنجی و تهیه لیست کتب مورد نیاز مدرسه اقدام به تهیه آنها از طریق خرید آزاد و خریداری از نمایشگاه های فصلی و ... می نماید.

      2 .طبقه بندی، سازماندهی و آماده سازی کتاب

کتاب ها بعد از ورود به مدرسه، مهر و ثبت شده، فهرست نویسی توصیفی، تحلیلی و کامپیوتری می شوند.

      3 . آسیب شناسی و مرمّت

در این قسمت با توجه به مقدار آسیب کتب فرسوده، این کتابها توسط کادر کتابخانه مرمّت و در صورت نیاز برای صحافی به بیرون مدرسه ارجاع داده می شود.  

      4 . اطّلاع رسانی

کتابخانه با اتخاذ سیستم قفسه باز جهت استفاده بهتر مراجعان و راهنمایی و مشاوره آنها در انتخاب کتاب، سعی در اطلاع رسانی صحیح نموده است.

       5 . برگزاری نمایشگاه های کتاب به مناسبت های مختلف

       6 . ارائه خدمات به متقاضیان و امانت کتاب

هم اکنون کتابخانه با 528 عضو فعّال از اساتید و طلاب در بخش امانت همه روزه از ساعت 30/8 صبح الی 13 بعدازظهر پذیرای مراجعان می باشد. اعضا می توانند تعداد 4 الی 5 کتاب را به مدت 14 روز به امانت ببرند.

جهت عضویت در کتابخانه اساتید و طلاب می توانند همه روزه با همراه داشتن کارت شناسایی یا فتوکپی شناسنامه و یک قطعه عکس جدید جهت ثبت نام مراجعه نمایند. در حال حاضر این فرایند به صورت سیستمی انجام می شود.